校園裡學生每天學習和接觸的對象，不是只有座位九宮格的範圍，不過指揮中心8日調整停課標準，國高中班級確診以九宮來匡列防疫假，除了國教行動聯盟指出，多數家長覺得離譜，台灣青年民主協會也怒批九宮格政策，截至目前有1800多位民眾和學生連署要求檢討，指揮官陳時中對此曾經回應，學校可以視實際情況做規定。

中央流行疫情指揮中心指揮官陳時中表示，「學校裡面已經沒有所謂的，匡列隔離這一個停課的標準，那所以學校可以視實際的情況，跟學生的教育權裡面做相關的一個停課的規定。」

政策上路倉促又缺乏配套，學生和家長不滿的怒火蔓延，教育部10日傍晚6點主動發函給各地方政府，重申防疫假規定，表示如果非九宮格內的學生，如果是基於防疫目的也能請防疫假，學校從寬認定，不要求附證明、不納入出缺席紀錄，也不扣減成績評量。

青年民主協會肯定教育部採納建議，呼籲學生和家長若遇到學校仍有不合理限制，可以直接向國教署反映。